Berdasarkan Perpres Nomor 96 Tahun 2013 tentang Tunjangan Kinerja Pegawai di Lingkungan Badan Meteorologi, Klimatologi dan Geofisika, kelas jabatan paling bawah di BMKG mendapatkan Tunjangan Kinerja paling kecil yaitu sebesar Rp 1.563.000,00. Adapun kelas jabatan paling tinggi yaitu pada kelas jabatan 17 mendapatkan Tunjangan Kinerja terbesar yaitu Rp 19.360.000,00.
